O dofinansowanie projektów w ramach Szwajcarsko-Polskiego Programu Współpracy mogą starać się: instytucje sektora publicznego i prywatnego oraz organizacje pozarządowe.

• bezpieczeństwo, stabilność, wsparcie reform:
  • inicjatywy na rzecz rozwoju regionalnego regionów peryferyjnych i słabo rozwiniętych
  • zwiększenie ochrony wschodnich granic Unii Europejskiej

  • -	rozbudowa wydajności administracyjnej,
    -	sposoby zabezpieczania granic,
    -	poprawa obsługiwanych spraw ze szczególnym uwzględnieniem kwestii imigracji i azylu,
    -	dostęp do informacji z zakresu prawa,
    -	modernizacja aparatu wymiaru sprawiedliwości,
    -	rozwój instytucji do walki z korupcją i przestępczością zorganizowaną,
    -	bezpieczeństwo nuklearne,
    -	zapobieganie klęskom naturalnym,
    -	regionalne inicjatywy rozwoju w regionach mało korzystnych.

• środowisko i infrastruktura:
  • odbudowa, przebudowa i rozbudowa infrastruktury środowiskowej oraz poprawa stanu środowiska (m.in. zarządzanie odpadami stałymi, systemy energii odnawialnej, poprawa wydajności energetycznej
  • poprawa publicznych systemów transportowych;
  • bioróżnorodność i ochrona ekosystemów oraz wsparcie transgranicznych inicjatyw środowiskowych

  • -	modernizacja zasadniczej infrastruktury dla wykorzystania energii i wody pitnej, utylizacji ścieków oraz usuwania śmieci,
    -	transport publiczny,
    -	poprawa warunków środowiska, redukcja szkodliwych emisji, rozwój i egzekwowanie standardów,
    -	usuwanie toksycznych odpadów, planowanie przestrzenne na poziomie miejskim, regionalnym i narodowym,
    -	różnorodność i ochrona natury.

• sektor prywatny:
  • poprawa środowiska biznesowego i dostępu do kapitału dla małych i średnich przedsiębiorstw (MŚP)
  • rozwój sektora prywatnego i promocja eksportu MŚP

  • -	rozwój sektora prywatnego z naciskiem na małe i średnie przedsiębiorstwa,
    -	poprawa dostępu do kapitału, wsparcie małych i średnich przedsiębiorstw w obszarze zarządzania i kierowania korporacyjnego,
    -	zachęcanie do uprawy ekologicznej; zachęcanie do produkcji przemysłowej,
    -	pozostającej w zgodzie z zasadą zrównoważonego rozwoju,
    -	poprawa regulacji sektora finansowego,
    -	ochrona własności intelektualnej.

• rozwój społeczny i zasobów ludzkich:
  • ochrona zdrowia (m.in. profilaktyka i kampanie promocji zdrowia oraz poprawa opieki społecznej)
  • badania i rozwój (m.in. Fundusz Stypendialny, projekty badawcze)

  • -	rozbudowa wydajności administracji publicznej w celu wyrównania do poziomu europejskiego; szkolenie zawodowe i techniczne,
    -	badania i rozwój – programy wymiany akademickiej, stypendia, partnerstwo, współpraca w naukach stosowanych,
    -	zdrowie – modernizacja szpitali, reformy systemu ubezpieczeń zdrowotnych,
    -	współpraca bliźniacza pomiędzy miastami i gminami,
    -	wspieranie międzynarodowych inicjatyw rozwoju.

Ogólna zasada: do 60% całkowitych kosztów kwalifikowalnych projektu/ programu;

Po stronie szwajcarskiej: Ambasada Szwajcarii w Warszawie (ocena projektów); Ministerstwo Spraw Zagranicznych, działające poprzez Szwajcarską Agencję ds. Rozwoju i Współpracy (SDC) oraz Ministerstwo Gospodarki, działające poprzez Państwowy Sekretariat do Spraw Ekonomicznych (SECO) – decyzje o dofinansowaniu;